Substrat merupakan bagian yang penting dalam bidang mikrobiologi industry. Substrat dibutuhkan dalam industry yang melibatkan mikroorganisme karena
- Mikro-oganisme untuk tumbuh dan menghasilkan produk, membutuhkan makanan. Makanan ini disebut substrat. Substrat yang sesuai sangat dibutuhkan.
- Selama pertumbuhan tersebut, mikroorganisme akan menggunakan substrat dan menghasilkan metabolit atau sel tergantung apa yang akan kita hasilkan
- Selama pertumbuhan mikroorganisme juga menghasilkan enzim. Enzim dibutuhkan untuk merombak substrat sehingga dapat membantu pertumbuhan organisme tersebut atau bahkan menjadi produk yang dapat dipanen untuk digunakan dalam proses yang lain.
Penggunaan enzim hasil dari mikroorganisme ini kini sudah sangat luas terutama enzim ekstra-selular. Salah satu contoh adalah enzim yang digunakan untuk mendegradasi lignoselulosa. Enzim ini banyak dihasilkan oleh jamur. Jamur pendegradasi lignoselulosa yang seing digunakan adalah Trichoderma spp yang menghasilkan enzim selulase dan xylanase. Enzim-enzim ini digunakan untuk biopulping. Untuk menggunakan enzim ini yang perlu kita perhatikan adalah bagaimana kita mengekstrak dan memurnikan enzimnya sehingga aktivitasnya tetap terjaga